Yûki et Zero partent en chasse pour capturer les terroristes qui prétendent servir le roi des vampires . Tandis qu'ils tentent de désamorcer une bombe, Zero, distrait par la présence d'une enfant, est enlevé par un groupe inconnu. Yûki et Maria, parties à son secours, doivent affronter un ennemi inattendu... Alors que la tension monte entre humains et vampires, le directeur de l'Académie Cross, Kaien Kurosu, se retrouve pris dans une émeute...
